براساس گزارش‌ها، طالبان از ورود دانشجویان دانشگاه البیرونی در کاپیسا جلوگیری کردند.
یکی از دانشجویان دانشگاه البیرونی در کاپیسا می‌گوید طالبان مانع از ورود دانشجویان شیعه در مسجد این دانشگاه شدند.علت این ممانعت را عدم ادای نماز توسط دانشجویان اهل تشیع پشت امام جماعت اهل سنت بیان کرده اند.
شفقنا به نقل از روزنامه اطلاعات روز (20 سنبله) نوشته است که دانشجویان به‌دلیل ازدحام در اتاق‌ها، از مسجد این دانشگاه، برای مطالعه نیز استفاده می‌کنند.
به‌گفته‌‌ی دانشجویان، نماینده طالبان گفته است «دیگر هیچ دانشجویی حق مطالعه در مسجد را ندارد، مگر این‌که پشت یک امام نماز کند».
مسجد دانشگاه دو طبقه دارد. نماز جماعت در طبقه دوم آن با امامت امام اهل سنت برگزار می‌شود.طبقه پایین مسجد مخصوص نمازهای انفرادی است.
